Das Asia Eastern Hospital hat in Zusammenarbeit mit Microsoft Taiwan und ATGENOMIX ein zentrales gen sequencing Cloud-System implementiert. Durch die Nutzung von Microsoft Azure in der taiwanesischen Region wurde die Plattform „Asia Eastern Precision Medicine Sustainable Platform“ geschaffen, die die Fortschritte in der personalisierten Medizin und klinischen Forschung beschleunigt. Damit ist das Asia Eastern Hospital das erste erstklassige medizinische Zentrum in Taiwan, das ein zentrales Genomsequenzierungssystem in die Cloud integriert hat.
Der General Manager von Microsoft Taiwan, Pien Chih-Hsiang, erklärte, dass das Asia Eastern Hospital die Datenanalyse des zentralen Genomsequenzierungssystems erfolgreich in die Azure-Region in Taiwan eingeführt hat. Dies schafft nicht nur ein neues Beispiel für cloudbasierte erstklassige medizinische Zentren, sondern ist auch das erste Projekt in Asien, das die Sequenzierung von Krebs- und genetischen seltenen Erkrankungen in Azure integriert. Durch die cloud-native Architektur und die lokale Compliance wird eine niedrige Latenz und eine flexible Skalierbarkeit ermöglicht, die riesige Genomdaten in Echtzeit umwandelt.
Microsoft betont, dass das System mithilfe der Azure-Region in Taiwan durch flexible Skalierbarkeit und automatisierte Mechanismen den Analyseprozess der Genomdaten in einem sicheren, konformen und latenzarmen cloud-nativen Umfeld beschleunigt. Das Ziel ist die schrittweise Verbesserung der Identifizierung von Hochrisikogruppen mit genetischen Veränderungen und deren Gesundheitsmanagement. Durch diese Plattform wird es möglich, klinische Referenzen über unterschiedliche Gesundheitszustände hinweg bereitzustellen, was eine frühzeitige Warnung und rechtzeitige Intervention zur Erhöhung der Erkrankungsprävention ermöglicht.
Um die Effizienz der Analyse und die Flexibilität der Anwendung zu steigern, arbeitet das Asia Eastern Hospital mit ATGENOMIX zusammen und nutzt deren Bio-IT-Cloud-Plattform-Dienst Atgenomix Seqslab, um ein eigenes Genomsequenzierungs-Cloud-System zu entwickeln. Das auf der Microsoft Azure Cloud-Plattform basierende System kombiniert flexible Skalierbarkeit mit automatisierten Prozessen, um große Mengen an DNA-Daten schnell zu verarbeiten und die Praktikabilität der personalisierten präzisen Medizin und klinischen Forschung zu beschleunigen.
Darüber hinaus hat das Asia Eastern Hospital eine Genomdatenbank aufgebaut und aktualisiert diese regelmäßig, um genetische Daten zu sammeln und zu analysieren. Jedes Quartal können Hunderte von Sequenzierungsdaten von Prüfkandidaten hochgeladen und sicher im Azure Data Lake gespeichert werden. Jeder Prüfkandidat hat etwa 700.000 genetische Variationen, und die Gesamtmenge an Daten ist erheblich, was als wichtige Grundlage für zukünftige Analysen oder Forschungen dient.
Um auf die ständig wachsenden Datenmengen zu reagieren und die Analyseeffizienz zu erhöhen, wird das System um NVIDIA Parabricks ergänzt, ein GPU-beschleunigtes Analysepaket für Genomdaten, um die Verarbeitungsleistung zu steigern. Dadurch wird die Analysezeit drastisch von ursprünglich vier Stunden auf nur noch zehn Minuten verkürzt. Darüber hinaus können große Datenanalysen, wie die gemeinsame Analyse des gesamten Genoms (WGG) von 2.500 Prüfkandidaten, ebenfalls innerhalb von 40 Stunden abgeschlossen werden, was eine Effizienzsteigerung um das 16-Fache bedeutet.
Der CEO von ATGENOMIX, Zhang Ming-Tai, betont, dass die Nutzung der Microsoft Azure Cloud-Plattform den wachsenden Anforderungen an Berechnung und Speicherung ausreichend gerecht wird und somit die Umsetzung präziser Medizin im klinischen Bereich ermöglicht wird.
